W roku 2552 ludzie na planecie Madrigal walczyli o niezależność od Ziemi, ale fatalne spotkanie z obcym ​​Przymierzem komplikuje sprawę. Do walki dołączają Master Chief i jego drużyna super żołnierzy – Spartanów. Po bitwie Master Chief udaje się na swoją rodzinną planetę, Reach, z ocalałym z Madrigalu i tajemniczym obiektem, który odkrył na planecie. Ale kontrowersyjny rozkaz sprawia, że ​​John kwestionuje jego misję i siebie.